化学研究部是公司成立最早、最基础，也是最重要的部门之一，本部门主要负责公司所有医药中间体、原料药及生物传导剂等各类化合物的合成研究，同时负责产品的中试工艺研究及其工业化生产的技术支持。
公司化学研究部拥有两个全新的实验室，所有仪器均为全新配置，完全可以满足一般有机化合物的合成要求，也可进行低温、高压化合物的合成。部门现有的研究人员配备科学合理，综合素质较高，所有研究人员均来自国内重点大学的有机合成及相关专业毕业的硕士研究生或本科生，都具有相当的药物合成经验。
至今，化学研究部已经成功自主研制出了一种治疗白血病药物，一种生物制剂的传导剂，并完成了siRNA 和DNA的原料化合物的国产化。
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